Al llegar a la estación de tren de la muerte, a un alma impura se le concede una segunda oportunidad de vida en contra de su voluntad. Al reencarnarse en el cuerpo de Makoto Kobayashi, un niño de 14 años que recientemente se suicidó, el alma tiene la tarea de identificar el mayor pecado del niño en la vida dentro de un límite de tiempo de seis meses. Aunque se muestra reacio a continuar su vida como Makoto, el alma pronto comienza a notar las complejidades de las emociones y acciones de las personas. Al deconstruir las ideas de familias divididas y el suicidio, Colorful (Movie) explora las complejidades de las luchas diarias que enfrentan los humanos, pero que están demasiado avergonzados para enfrentar.
